Czy jest możliwość dodania pliku PDF do wiadomości wysyłanej do klienta

Jest taka możliwość. Należy umieścić plik na serwerze np. w katalogu files/, a następnie przejść do PA > Ustawienia > Szablony,

a następnie wyedytować szablon wiadomości do klienta po złożeniu zamówienia, dodając w jego treści odnośnik do ww pliku.